Основна відмінність комплексної експертизи полягає в тому, що у ній беруть участь фахівці різних спеціальностей (Ч. 1 ст. 85 АПК). Подібність із комісійною експертизою полягає лише в тому, що експертиза проводиться кількома (не менш як двома) експертами.

Відповідно до ст. 200-й КПК України комісійною експертизою вважається така, у якій беруть участь експерти однієї спеціальності, а відповідно до ст. 201-й у комплексної експертизи беруть участь експерти різних спеціальностей.

Комплексна експертиза Комплексний називають експертизу, яка проводиться експертами різних спеціальностей. Таку експертизу призначають, коли поставлені судом питання торкаються кількох галузей знань, а формулювання висновків виникає у участі експертів різних експертних спеціальностей.

Комісійна експертизаекспертиза (судова та позасудова), що проводиться двома або декількома (але не менше двох) експертами однієї або різних спеціальностей. Комісійна експертиза може бути однопредметна та багатопредметна. А також до експертної комісії можу входити експерти однієї та різних спеціальностей.