Основна відмінність комплексної експертизи полягає в тому, що у ній беруть участь фахівці різних спеціальностей (Ч. 1 ст. 85 АПК). Подібність із комісійною експертизою полягає лише в тому, що експертиза проводиться кількома (не менш як двома) експертами.
Відповідно до ст. 200-й КПК України комісійною експертизою вважається така, у якій беруть участь експерти однієї спеціальності, а відповідно до ст. 201-й у комплексної експертизи беруть участь експерти різних спеціальностей.
Комплексна експертиза Комплексний називають експертизу, яка проводиться експертами різних спеціальностей. Таку експертизу призначають, коли поставлені судом питання торкаються кількох галузей знань, а формулювання висновків виникає у участі експертів різних експертних спеціальностей.
Комісійна експертиза – експертиза (судова та позасудова), що проводиться двома або декількома (але не менше двох) експертами однієї або різних спеціальностей. Комісійна експертиза може бути однопредметна та багатопредметна. А також до експертної комісії можу входити експерти однієї та різних спеціальностей.